WinとMac で色が違う。

僕もまだ検証している最中ですが、似た様な経験をしました。
G5 QuadにKONA LHeを入れているのですが、とある会社のCMの映像を非圧縮HDのAVIで納品する事になったのですが、Macでしか非圧縮、HDSDIで取込む事が出来ないのでMacで取り込み、非圧縮のQTをWindowsに読み込ませて非圧縮のAVIに変換しました。
ですが、Windows側で見ても若干明るく（白っぽく）なってしまうのが明らかでした。
色々やってみるとMac側でAVI化した物をWindowsに持って行けば殆ど差がない状態で行けるので、その方法を選びましたがMacで作るAVIの再大容量に引っかかってしまう可能性を考えて5秒ごとに切り分けAVIを作り、それをWindowsに持って行ってまた非圧縮AVIにするという、一見全く無意味に思える処理をしてなんとか納品する事が出来ました。
Mac側で受け取るのとは逆の作業をですが、上記の事からある特定のカーブ（MacとWinでのガン***ブの違いを打ち消す値、、波形モニターで見ましたがリニアな特性ではなかったです）を持っているので、MacやWinの設定で解決出来る範囲の話かも知れません。
一度、双方でカラーバーを出し入れしてみて、どう変化するのか、どの設定なら変化が少ないかを実験してみてはいかがでしょうか？
ずばりな回答が掛けずに申し訳有りませんが、何かヒントになればと思います。。

WinとMacの両OSの基本ガンマ値が違うので、色味を同一にする事は難しいでしょう。
受け取ったWinのムービーをガンマ補正して近づけることは可能ですが、同一にはなりません。
私の場合はWindowsで触った映像をMacで使う時は、テープに落として取り込み直してます。

そうなんですよね。
ただ、実際の制作環境下ではMac、Winを併用している方も多いと思うんです。
Macから書き出したAVIは変化が少ない様ですので、もし時間がありましたら山田太郎さんの環境でも試してみていただけたらと思います。