ipodのフォーマットについて

フォーマットだけならディスクユーティリティーでHFS＋に変更できますが、プレーヤーとしても使うならiPod Updater で復元させます。
http://docs.info.apple.com/jarticle.html?artnum=60983

Mac 用の iPod Updater を入手して、それを用いて「復元」するとよいです。ただし、この作業をすると iPod の中身は全部消えてしまいますので、要注意です。

迅速なお返事ありがとうございます。やっぱりiPodの中身を消さずにフォーマットをかえるのは無理なんですかね？

買い換える前のパソコンがあって、そのiTunesフォルダにデータが全て揃っていれば、それをMacにコピーして、新しいMacのitunesで認識させ、MacフォーマットしてまっさらになったiPodにシンクさせる。というのが正規の方法ではないでしょうか。
iPodを使いこなすには、「ありがとうiPod」という有用なＨＰをご一読あれ。
http://arigato-ipod.com/index.html

＞やっぱりiPodの中身を消さずにフォーマットをかえるのは無理なんですかね？
はい、残念ながら技術的に困難です。どうせ、WIndows → Mac へのデーター移行でいろいろ作業が必要なので、その一環と思ってあきらめましょう。面倒ならば Windows フォーマット (FAT32) のまま Mac で使ってしまう手もありますが。
音楽データーは Windows → Mac のパソコン間で移動できていると思うので、あとは iPod をディスクとして使っていた場合に、中に入れていたデーターを取り出しておくのを忘れないように、というぐらいでしょう。
# 曲を iPod にしか入れてない、という困った状況の場合は、いっぱい過去事例があるので検索して調べてください。