一部の項目が見つからない

こういう時は、一からやり直したほうが早いです。
ライブラリのデータを全て消す。　ただし、ゴミ箱に入れない。
データをdrag&dropで再登録。
で、どうでしょうか。

ITunes 上のリストから曲を選択していくと、「！」が出るものがありませんか。それがあったら新しい場所を指定し直します。少しならこれでなんとかなります。あるいは更新の時の情報で何が見当たらないのか明確なのであればもっと話が早い。
最近の iTunes では治ったみたいなんですが、以前のバージョンで、NAS 上に曲を置いていたりすると、よくランダムに「！」が出たもんです。検出するアップルスクリプトもあったような気がするけど忘れました。

早速アドバイスをいただきありがとうございました。
問題になるデータは特定できているので、それらについて再登録をしてみましたが、結果は変わりませんでした。
ご指摘どおり全データを再登録するしかなさそうですが、ライブラリには約５０００曲の登録があり、これをひとつひとつdrag&dropするのは大変です。一度にまとめて再登録する方法をご存知でしょうか。怠け者ですみません。

ありがとうございます。
警告が出る対象データは特定できていますが、「！」は出ていません。
データがMPEG-1という種類のものだからだめなんでしょうか。

>データがMPEG-1という種類のものだからだめなんでしょうか。
MPEG-1ファイルは、iPodに同期できません。
「一部の項目が見つからない」というアラートは妙ですが…。

>一度にまとめて再登録する方法
　その約5000曲を含むフォルダをデスクトップにでもコピーし、
　ライブラリから全曲を削除し、
　デスクトップにコピーしたフォルダをitunesのウインドウにドラッグ＆ドロップ
でどうでしょうか。

＞MPEG-1ファイルは、iPodに同期できません。
もしかしたら、MPEG1 Audio Layer3の事を言ってるんじゃないでしょうか。
それなら、正常な状態であれば同期できます。＞Clintonさん
それは、MP3の事ですから。

みなさん、ありがとうございます。
データ形式が問題という訳ではなさそうですね。
以前同期したときのデータがiPODに残っていたので、itunesを使ってそれらを一旦削除、その後、同期し直すと、例の「見つかりません警告」はでるものの、データはちゃんと同期できていました。
同時はできているので問題ない、と言えばそうなのですが、それでも、「見つかりません警告」が気持ち悪い。とは言え、「今後はこの警告を出さない」ようにしてしまうと、本当に同期できない事象が起きたことを把握できないので問題。
いい解決策はないものでしょうか。