２つ以上の内蔵HDDをTime Machineで1台の外付けHDDヘ....

> この２つのHDDをTime Machineで同時にバックアップをとりたいのですが、
可能なのでしょうか？
Time Machineはちょっと普通のバックアップソフトとは感覚が違います。ので難しく考えずとも外付けHDDをつければ今の環境をそのまま保存して言ってくれます。内部HDDが2台だろうが３台だろうが。ただ内蔵合計の750GB以上はあったほうが良いので1TBとかになるのでしょうね。
> 個別にバックアップされるのでしょうか？
これは逆に明示的に個別にバックアップしたいという意味でしょうか？　それならば市販のバックアップソフトの方が向いているかも知れません。 うーん、使ってみないと感覚が難しいですが、Time MachineはバックアップソフトというよりずばりTime Machineソフト（余計意味分からん(^^;　）なんですよねぇ。。。
# 私は普通のバックアップソフトも使いわけてます。
> 複数のMACで1台の外付けHDDを利用することも可能
用途によって方法が幾つかあります。

＞この２つのHDDをTime Machineで同時にバックアップをとりたいのですが、
可能なのでしょうか？
はい、可能です。やり方は、Leopardをインストールして10.5から10.5.1にアップデートしてTime Machineバックアップ用の外付けHDDを接続するだけ。外付けHDDがデスクトップに正常にマウントされたら、あとはTMが自動的に検出してyoshida-stさんの許可を得た上でバックアップ先に指定してくれます。
＞個別にバックアップされるのでしょうか？
TMがバックアップするすべてのHDDのバックアップを作り終わったら、外付けHDDのアイコンをダブルクリックして、フォルダを次々に開いてみて下さい。バックアップ元の各HDDの名前を冠したフォルダができているはず。つまり、内蔵のMacintosh HD含め、デスクトップにマウントされていて除外アイテムに指定していないすべてのHDDが個別にバックアップされている、ということです。
＞複数のMACで1台の 外付けHDDを利用することも可能だとわかりましたが.....
この場合も、複数のMacのそれぞれのバックアップフォルダが作成されます。
（以上、usadii 3 さんとの重複御免）
[バックアップは起動ディスクから]
TMで初回バックアップを作成する時は「システム及び起動ディスク」つまり「最初からある250GBのHDD」のみ、先に作っておくことをお奨めします。他のHDDはオプションで除外しておき、初回バックアップが成功裡に完了したら、除外指定を取り消してバックアップ対象に加えます。
全部のHDDをいっぺんにバックアップしてもかまわないのですけれど、万一500GBの方のHDDに破損した（または壊れかけの）ファイルが含まれていると、たとえシステム／起動ディスクに問題がなくても、バックアップが途中で挫折することがあるのです。そうすると一から出直しになって時間の無駄ですので。

＞Time Machineはちょっと普通のバックアップソフトとは感覚が違います。
そのとおり。「普通のバックアップソフト」というよりは、まさかのクラッシュに備えての環境復元ソフトですね。個々のファイルを永久保存するためのものではなくて、天災人災でMacのハードディスクが突然こわれた時、嘆き悲しむ人の数をなるべく減らしたい、なるべく手間をかけずにクラッシュ前の環境にすみやかに戻してあげたいという思いやりから生まれたソフト。クラッシュ時以外の使い道もあります。（OSを旧バージョン／リヴィジョンに戻したい場合など）
＞# 私は普通のバックアップソフトも使いわけてます。
私も。TMはバックアップディスクがいっぱいになると日付の古い順にバックアップファイルを消してスペースを作るしくみなので、消えては困る重要データはTMとは別の方法でバックアップしておく必要があります。つまり従来のバックアップシステムとの併用が望ましい、ということ。（手間が増えたじゃないの〜！）

>TMはバックアップディスクがいっぱいになると日付の古い順にバックアップファイルを消してスペースを作るしくみなので
はい。ですが、消えるファイルは「より新しい日付のファイル」があるものに限られます。日付が古くても、それが最新のファイルであれば、Time Machineは残し続けます。
そのため、Time Machineは従来のバックアップの用途にも十分に利用できます。
>消えては困る重要データはTMとは別の方法でバックアップしておく必要があります。
HDDからうっかり消してしまって、そのまま数ヶ月も気付かないおそれがある場合。
内容を変更した数ヶ月後に、元のファイルが欲しくなるおそれがある場合。
このようなファイルについては、従来のバックアップが必要です。
（私も、保存用データは光学メディアにバックアップしています。）
以上、ご存知と思いますが、念のため。

>> 消えては困る重要データはTMとは別の方法でバックアップしておく必要があります。

> HDDからうっかり消してしまって、そのまま数ヶ月も気付かないおそれがある場合。
> 内容を変更した数ヶ月後に、元のファイルが欲しくなるおそれがある場合。
私の場合はまさにそれらの意味＋データが無くなるとものすごい損害になるので、後で泣かない為に２つ３つとデータだけは複数バックアップを用意しておく必要がある為、でしょうか。