BSD装置名は変更できないのでしょうか

あてずっぽうですが、一旦AirMacも外して再起動し、再度入れてみたらどうなるでしょうか？

セーフブートしてみるとどうですか？

たしか、ネットワークの環境を作成毎に割り当てられるはずなので、
ネットワークの環境を作り直してみてはどうでしょうか。
システム環境設定→ネットワーク→ネットワーク環境→新しいネットワーク環境
上記で新しく作成した後に、システムプロファイラの
ネットワーク→ネットワーク環境を確認してみてください。
新しく作成したネットワーク環境名を右側から選択して
下部内容を確認していただければ、内蔵Ethernet：en0　AirMac：en1に
なっていると思います。
その確認後に、不要な古い方のネットワーク環境を削除すれば
ご希望通りの状態になると思いますよ。

・AirMacカードの取り外し
・セーフブート
・キャッシュのクリア
・ネットワーク環境の新規作成
をやってみましたが変化ありませんでした。
MacOS9のころは、初期設定をごみ箱に捨てればたいていの事は初期状態に戻せたのですが、
OSXになってからは設定ファイルがシステムの奥の方にしまわれてるのでなかなか手が出せませんね・・・

> キャッシュのクリア
念のため、どうやってクリアされましたか？/System/Library/Extensions.kextcacheや/System/Library/Extensions.mkextをクリアする必要があると思います。
Onyxならカーネルキャッシュもクリアしてくれたと思いますが、AppleJackあたりが強力かと思います。

キャッシュのクリアはTiger Cashe CleanerのDeep Cleaningで行いました。
AppleJackについて軽く調べてみましたがシングルユーザーモードで機能するという事でかなり強力そうですね。

AirMacカード取り外し
AppleJack実行
PRAMのクリア
AIrMacカード取付け
とやってみましたが依然もとの設定のままでした。
やはり、キャッシュではなく設定ファイルを探し出して修正するしか方法はないのでしょうか。

> キャッシュではなく設定ファイルを探し出して修正する
こういうのは設定ファイルなどないと思います。起動時にカーネルにドライバーをロードするときに対応する装置が検出され、その順番に番号がついてゆきます。なぜいつまでも en2 になるのかわかりませんが、en1 が付いているか、そのドライバーがまだロードされるようになっているとしか思えません。なのでやはりキャッシュが問題と思われるのですが。こんなにいつまでも解決しないなら、ディスクを再フォーマットしてまっさらにした上で、再インストールする方がはるかに速いです。OSX には移行アシスタントとかいろいろなツールが利用できるので、２−３時間もあればまっさらな状態からもとの状態に戻せます。

UNIXではネットワークインターフェースについて記述したファイルがあるとどこかで見たような気がしたので、ひょっとしたらOSXにもあるのかと思っていました。
やはり、再インストールが手っ取り早いようですね。
ネットワークの設定で若干不都合があるものの普通に使う分には問題なかったので、なかなか踏み切れずにいたのです。

まだ調査中ですが、ネットワークに名前をつけているのはconfigdのInterfaceNamerというプラグインのようです。以前は/var/db/NetworkInerfaces.xmlといういかにもそれっぽい初期設定ファイルから読み込んでいたようなことが書いてありますが、Tigerでは使っていないのか、私のところにはありません。（AppleJackはこのファイルも削除しています。）
ちなみに、ioregコマンドでは、古いドライバは消えているのは間違いないですか？

> /var/db/NetworkInerfaces.xml
/Library/Preferences/SystemConfiguration/NetworkInterfaces.plist がそれにあたるのでは？

ドライバはマニュアルに載っていた物を削除しました。
ちなみにプラネックスのGW-US54Mini2Wで、
削除したファイルは
http://www.planex.co.jp/support/download/wireless/gw-us54mini2/html_mac/menu-3-4.html
に記載されているものです。
ioregコマンドを実行してみましたが
radioの所にAirportDriverとAirportUserClientがあるのは確認できたのですがその他のファイルは無いようです。
他のツリーに表示される事もあるのでしょうか。

Ibrary/Preferences/SystemConfiguration/NetworkInterfaces.plist
を確認してみるとen1には
RT2573USBWirelessDriver
が割り当てられているようです。
システム/ライブラリ/Extensionsにはそのようなファイルは存在していません。
試しにNetworkInterfaces.plistをコピーして修正してみようと思います。

そうかもしれません。configdのmanにも書いてありますね。
中身を確認し、編集してしまうか、別の名前に変えて再起動してみたらどうでしょうかね？

/Library/Preferences/SystemConfiguration/NetworkInterfaces.plist
を確認してみるとen1には
RT2573USBWirelessDriver
が割り当てられていました。
若干名称は異なりますがもともと使っていたネットワークインタフェースのドライバRT73USBWirelessDriverのような気がします。
システム/ライブラリ/Extensionsには同名のファイルは存在しなかったので、念のためNetworkInterfaces.plistのコピーをとって編集してみました。
具体的にはen1の情報を削除、en2の内容をen1に置き換えて再起動しました。
再起動後システムプロファイラでネットワークを確認したところAirMacがen2と表示されてがっくり来てしまいましたが、
前の項目にあったようにネットワーク環境を作り直してみたらAirMacがen1となりました。
しばらく使ってみて問題が無いようならこのまま行きたいと思います。
アドバイスをくださった皆さんありがとうございました。