NOCK'sさん、こんばんは。
HDDの違いで結果に差があるというのも、ちょっと気にはなりますね…。
プラグインじゃないとなると、他社製アプリとなにか競合でもしているんでしょうか。
他社製アプリが、バックグラウンドで動かしてるものがあれば、このへんに入っていると思います。
システム環境設定→アカウント/ログイン項目
ライブラリ/LaunchAgents
ライブラリ/LaunchDaemons
ライブラリ/StartupItems
バックグラウンドで動いているのの名前がわかれば、アクティビティモニタで終了させてから、iMovieで書き出しを試す、という手もありかと…。
(はたして強制的に止めていいやらどうやら…という場合はお止めくださいね)
根本解決にはなりませんが、問題を切り分ける意味で「新規ユーザで試す」はどうでしょう。
→ 問題は再現しない → いつも使ってるユーザだけの問題 → ホームフォルダの設定ファイルなどが怪しい
→ 問題は再現する → 起動ドライブ直下の「ライブラリ」などが怪しい
あと、カメラメーカーのサンプルファイルでも同じことが起きてるようですから「カメラの保存形式以外のムービー以外で試す」も、念のため(確認済みならごめんなさい…)
QuickTime: サンプルファイル
http://support.apple.com/kb/HT1425?viewlocale=ja_JP
音が消えてしまうムービーをiTunesで読み込んで「iPod/iPhoneバージョンを作成」してみるのも、確認になるかもしれません。
どんなファイルでも、どのアプリでも同じことが起きるとなると、QuickTimeがおかしくなってる…という可能性もなきにしもあらず…かも…です。
ところで、ソフトウェアアップデートはされていますか?
「iLife サポート」のバージョンが低いと、けっこうトラブルが出るようです。
【追伸】iMac G5 2.1GHz メモリ1.5GB/OS 10.5.8/iMovie 8.0.6 で、Xactiのサンプルファイルを書き出してみましたが、音はなくなりませんでした。