旧Macと同期したiPhoneを新しいMacと同期したい

ご質問内容があまりにも漠然としているので確認しますね。「旧Macと同期してあるiPhoneを新Macと同期したらiPhoneの中の音楽ファイル、写真ファイルが消失してしまった。どのようにすればもともとiPhoneにあったデータを維持しつつ新Macと同期が出来るのか？」ということでよろしいでしょうか。それであれば旧Macから新MacへiTunesやiPhoto等のライブラリ等必要な物を全てを移行して下さい。iPhoneからMacへのデータの移行、コピー等は原則出来ません。

もし同期出来ないというのが上記の事ではなく新MacのiTunesでデバイスとして認識されないという事であれば旧Macでバックアップを取った上でリカバリーを試してみて下さい。

ご参考：

「Re: 今のマックと同期をやめ、他のマックと同期させたい」

旧MacのiTunesでバックアップをとっているならそこから復元して下さい。ただバックアップをとった以降のSMS/MMSは残念ながら復旧は出来ません。

ここで注意しなければいけない事があります。旧Macで同期をとると以前のバックアップに上書きして今の状態がバックアップされます。そうすると以前の状態には戻せなくなりますので気をつけて下さい。

ひょっとして旧MacのOS、iTunesのバージョンが低くてiOS4.2.xのiPhoneを認識出来ないというトラブルでしょうか？。それでしたらiPhoneのバックアップファイルの場所は

/Users/username/Library/Application\ Support/MobileSync/Backup

になりますのでこちらを旧Macから新Macに移せばどうでしょうか。

以上の事はNO9さんが示していただいたリンク先の方が詳しく書かれていますのでぜひそちらもご一読ください。