考えられるのはAudio folderのアクセス権ではないかと思います。
Terminalに下記コマンドを入れてRetrunで...
ls -la /Library/Preferences/Audio
表示したアクセス権を確認して下さい。
drwxrwxr-x root _coreaudiod . この設定ならこれ以外に問題があると思います。
drwxr-xr-x root wheel ..
-rw-r--r-- _coreaudiod _coreaudiod com.apple.audio.DeviceSettings.plist
-rw-rw-r-- _coreaudiod _coreaudiod com.apple.audio.SystemSettings.plist
root -coreaudiodに修正するコマンドです。要Password コマンド実行後に再起動して下さい。
sudo chown root:_coreaudiod /Library/Preferences/Audio
Audio folderの2つのFileは捨てても再起動で問題ないFileを生成しますので確かめられるほうが...
あと/Library/Preferencesや$HOME/Library/PreferencesとByHostを見ましたが該当するPLISTはありません。当方が使ってないからかも知れませんが...