Mountain Lionにアップしても、そのままVISTAが利用できますか?それとも7にアップしないと動きませんか?
Winが起動してしまえば、後はその辺のPC/AT互換機と何ら変わらないわけで、一方のOSが他方に影響を及ぼすことは無いはずです。まぁ、Snow LeopardからLionに移行したときみたいに、リカバリーパーティションの問題でLion以降に付属のBootCamp関係(Winサポートソフトウェア)でないと、起動の切換等がうまくいかない等という話はあるでしょうけど、そういう話でなければ問題は無いはず。
既存のbootcampパーティションにあるVISTAは動くが、新しくbootcampで作成したパーティションにはWINDOWS7しかインストールできない。。。との意味でしょうか?
Mountain LionのBootCampでVistaに対応したWinサポートソフトウェアが提供されているなら問題無いはずです。要は対応したWinサポートソフトウェアが提供されているかどうかかと思いますが。
追記:
「Boot Camp 4.0 のシステム条件」、「お使いの Mac に、Windows XP または Windows Vista をインストールした Boot Camp パーティションがある場合は、その Boot Camp パーティションを使い続けることはできますが、Boot Camp 4.0 にアップグレードすることはできません。」、Lionでも新規でWin Vistaのインストールは無理ですね。
「Boot Camp 4.0 で使用できる Windows のバージョンはどれですか?」にも「Boot Camp 4.0 では、Windows XP および Windows Vista はサポートされません。」ってありますね。
BootCamp 3で使い続けるしかないようですね。