CPU,コア数の変更および戻すターミナルコマンドが分かる方はいないでしょうか？

再起動してもコア数の制限が効いているなら、NVRAM に設定が書き込まれているのでしょうね。

nvram boot-args

としたとき、何と出力されますか。

boot-args cpus=6

とか返してくるようなら、boot-args 変数を以下のコマンドでクリアすればよいでしょう。

sudo nvram boot-args=""

但し、boot-args に cpus 以外の値が設定されている場合は、その変数を再設定する必要があります。

cf.

Technical Q&A QA1141 Disabling Processor Cores on a Multi-Core System

https://developer.apple.com/library/mac/qa/qa1141

chandana さんによる書き込み:

再起動してもコア数の制限が効いているなら、NVRAM に設定が書き込まれているのでしょうね。

二つのHDD で症状が違うようですのでPRAM ではないのでは無いでしょうか。

Alicia による書き込み:

当時の同アプリケーションユーザーの間でシステム自体の使用CPUおよびコア数を制限するターミナルコマンドと言うのを教わり、泣く泣く使用しました。

どのようなコマンドだったか、思い出せないでしょうか。