Spotlightで外部HDの検索が出来ない

Spotlightの検索について質問させていただきます。

Mac miniを使用しています。(使用機器参照)

最近Mac miniの動作が不安定になったためYosemiteの再インストールを行いました。

再インストール後以下の症状が発生し困っています。

：Mac miniに接続しているすべての外部HDのファイルがSpotlightやFinder検索窓から検索できない。

外部HD内のファイルは開くことができるのですが

SpotlightやFinderの検索窓でファイルを検索できません。

内臓HDだけはSpotlight、Finderの検索窓で正常に検索可能です。

問題解決のために、Mac miniに外部HDを４台接続した状態で、下記の「Spotlight：フォルダとボリュームの再インデックス方法」を実行しました。

手順「5」の「確認を求めるメッセージが表示されたらOKをクリックします」とありますが、結局確認メッセージが表示されないため、手順「７」まで進みシステム環境設定を閉じました。

その後、Spotlight検索で文字入力したところ、外部HDの中のファイルは相変わらず検索できないのですが、文字検索の下に以下の画像の通り「索引を作成中」と表示されるようになりました。

この索引作成が完了すれば外部HDの検索が可能になるのでしょうか？

現在すべての外部HDから動作音がしています。

作成が完了するまでHDの電源はつけておかないとHD内のファイルが壊れたり問題が発生する恐れがあるのでしょうか？

外部HD4台で約3.5テラバイトほどのファイルが入っています。

時間がかかるのでしょうか？

以上お手数ですがアドバイスいただければ幸いです。

よろしくお願いいたします。

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Spotlight：フォルダとボリュームの再インデックス方法

https://support.apple.com/ja-jp/HT201716

1 Apple () メニューから「システム環境設定」を選択します。

2「Spotlight」をクリックします。

3「プライバシー」タブをクリックします。

4 フォルダまたはボリューム全体 (ハードディスク) をリストにドラッグします。

5 確認を求めるメッセージが表示されたら、「OK」をクリックします。

6 リストに追加したばかりのフォルダまたはボリュームをクリックし、マイナス (「-」) ボタンをクリックして削除します。

7 「Spotlight」パネルを閉じます。

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[使用機器]

1. Mac mini Late 2012 [MD387J/A] 2.5GHz, Core i5

OS X Yosemite バージョン 10.10.4

2. ハードディスク:

Western Degital WD30EZRX-1TBP [2台] ExFATでフォーマット　

Hitachi HDP725050GLA360 [2台] HFS+でフォーマット

3. HDDスタンド: KURO-DACHI/CLONE/U3 [2台]

4. ケーブル: ELECOM USB3.0ケーブル A-Bタイプ ノーマル 2m U3C-20BK [2本]