起動ディスクをUSB接続だと起動するがSATA接続だと起動しない

内蔵ストレージにすると起動しないという事でしょうか。交換してもダメとなると相性が悪いという話になりますが、とりあえずそのHDD の型番を書き込むと何か情報が集まるかもしれません。

usb接続というのは、外付けhddケースに入れてる時の話、sata接続というのは、macbook pro のhddベイに入れた時の話ですよね？

> SATA接続にすると駐車禁止マーク

option 起動にしても起動できませんか？

普通に起動すると駐禁マークが出て起動できないときでも、option起動だと起動ディスクとして認識され、正常に起動した経験もあります。option 起動でしか起動できないのは、最初だけで、次回からは普通に起動できるようになりましたけど。

それから、pramクリアだけじゃなくて、smcリセットしてみても変わりませんか？

どうしてもダメなら、内蔵した状態で、復元なり、osxのインストール（インストール後、移行アシスタントでtimemachineから元の状態に戻す）をしてやれば良いと思いますけど。

復元する前に、そのhddをディスクユーティリティでフォーマット（guidパーティション方式、macos拡張）してますよね？

インストールを始められるという事は、フォーマットは内蔵状態でもできるという事ですよね。もしUSB のときにフォーマットしたのであれば内蔵でパーティションマップごとフォーマットし直してみてはいかがでしょう。

> 内臓でパーティション削除してフォーマット

これって、macosxが要求するguidパーティション方式になってますか？

フォーマットはmacos拡張ですが、それ以上にguidパーティション方式は重要です。この方式のパーティション方式になってないといくらmacos拡張でもmacosxを起動できません。ディスクユーティリティでhdd本体を選択して、窓の下段に表示される情報にパーティションマップというのがありますが、ここがGUIDパーティションマップになってますか？

あるいは、hdd自体に、WIndowsで使うための変なフォーマットがされてるとか。その時は、ディスクにパーティションマップとか何も書かれてない状態にしてから、改めてフォーマットし直してやる必要があります。

今まで、同じようなことを何度もやりましたが、（不良品は別にして）使えないhddって出会ったことありません。ただ、ターミナルでfdiskコマンドで初期化してから、さらにディスクユーティリティでフォーマットしてやらないと使えないとかいうケースには出会ったことあります。

モデルも2012でそれほど古いわけではありませんし、フォーマットが正しいのだろうか、と疑問に思います。

フォーマットが正しくてこうなってしまうのなら、ロジックボードに問題がある可能性もあると思います。

Apple Hardware Testをかけてチェックしてみるとかですかね。

症状が多彩になりましたね。はに さんもお書きですがパーティションマップを確認して下さい。一旦、マスターブートレコードでフォーマットしてからGUID パーティションマップにすると確実に再作されます。

USB メモリでも起動しないとなると、どこかが故障の可能性が高くなります。

> 試しにEl CapitanのインストールUSBメモリを作って

これは、あらかじめguidパーティション方式でフォーマットしましたか？