OS X 10.11.6にアップデートして書き出し時のログを比較してみました。
テーマがクラシックと雑誌の時のみ下記のログが出力されます。
2016/08/11 3:27:51.123 Photos[577]: [03:27:51.123] CMSampleBufferGetImageBuffer signalled err=-12744 (kCMSampleBufferError_Invalidated) (sbuf invalidated) at /Library/Caches/com.apple.xbs/Sources/CoreMedia_frameworks/CoreMedia-1731.15.206/Sources/Core/FigSampleBuffer/FigSampleBuffer.c line 2399
0 CoreMedia 0x00007fff8e9b4713 CMSampleBufferGetImageBuffer + 138
1 MediaToolbox 0x00007fff8a823d6c FigSampleGeneratorCreateForFormatReaderProducingByteReferenceSampleBuffers + 17094
2 CoreMedia 0x00007fff8e9e3301 FigScheduledFileIOThread + 4316
3 CoreMedia 0x00007fff8e9ec82e figThreadMain + 616
4 libsystem_pthread.dylib 0x00007fff9bdb999d _pthread_body + 131
5 libsystem_pthread.dylib 0x00007fff9bdb991a _pthread_body + 0
6 libsystem_pthread.dylib 0x00007fff9bdb7351 thread_start + 13
2016/08/11 3:28:04.447 Photos[577]: reported progress 0.001980
2016/08/11 3:28:04.465 Photos[577]: reported progress 0.004905
2016/08/11 3:28:04.484 Photos[577]: reported progress 0.009166
2016/08/11 3:28:04.510 Photos[577]: reported progress 0.017753
フレームワーク関連の問題みたいなので、アップル側で何かしら対応しないと解決できない問題のようです。
しかし、core 2 duo以降のcpuを搭載したMacでは、すべてのテーマで書き出しができるようですので(エラーが出力されても)表立った実害がないので放置となるかな〜と考えます。
対応するとしても次期OSからでしょうから、El Capitan止まりのMacに於いては事実上……😠😟