再起動するとdockの表示が初期設定に戻ってしまいます。

Preferences内にcom.apple.dock.plistは何故か再生成されていません。

青リンゴ さんがお書きの様に、ホームフォルダ内の ~/Library/Preferences ではなく、ルート直下の /Library/Preferences の「com.apple.dock.plist」を削除していませんでしょうか？

（その場合は、「ゴミ箱」を開いて「com.apple.dock.plist」を選択し、右クリックすると表示されるコンテキストメニューから「戻す」を選択して下さい）

「Finder」を開き、「移動」メニュー ＞「フォルダへ移動」で表示されるダイアログの入力フィールドに、~/Library/Preferences　をコピー＆ペーストで入力し、「移動」ボタンをクリック。

「Preferences」フォルダ内の「com.apple.dock.plist」を「ゴミ箱」に入れて直ぐに「Finder」を閉じ、Mac を再起動です。

ログイン後に使い易い状態に設定してから再び Mac を再起動し、「Dock」の設定が維持されているかどうかを確認。

失礼致します。

別のユーザアカウントでは、再起動しても「Dock」の設定が維持されますでしょうか？

Mac で別のユーザアカウントを使って問題を検証する方法 - Apple サポート

一旦「com.apple.dock.plist」を「Prefarences」から出してみましたが変化なかったので戻しました。

OS X El Capitan（10.11.x）では、~/Library/Preferences/com.apple.dock.plist を削除、或いは退避させても、暫くすると Caches から戻されてしまいますので、別のユーザアカウントでは再起動しても「Dock」の設定が維持され、当該のアカウントでのみ不具合が発生する場合は、問題のアカウントにログインし、~/Library/Preferences/com.apple.dock.plist を「ゴミ箱」に入れたら直ぐに Mac を再起動してからログインして下さい。

不具合の無い「com.apple.dock.plist」が再生成され「Dock」が初期状態になっていますので、pointpoint さんの使い易い状態に設定してから再び Mac を再起動し、「Dock」の設定が維持されているかどうかを確認して見て下さい。

その中で自分には必要ないのですが「Pages、Numbers、Keynote」は「？」表示になっています。

「？」表示になっている「Pages」、「Numbers」、「Keynote」アイコンを各々「Dock」から離れたデスクトップ上にドラッグ＆ドロップして「Dock」上から削除して下さい。

pointpoint さん、返信が遅れてすみません。

再起動しても「Dock」の設定が維持される様になったとの事で、まずはおめでとうございます。

並んでいた「com.apple.dock.db」もゴミ箱に移動。←必要であれば戻します。

ホームフォルダの ~/Library/Preferences 内に、「com.apple.dock.db」は再生成されていますでしょうか？

私の環境では、ホームフォルダの ~/Library/Preferences 内に、「com.apple.dock.db」自体存在していませんが、「Dock」は全く正常に機能していますので、無くても問題無い様に思います。

アカウントを追加して（同じ設定）送信→受信するとうまくいきます。

ファイルを添付しても送受信OKです。

ですが、突然、送信だけできなくなってしまいます。

アカウントを追加して暫くは問題無いが、突然、送信だけ出来なくなってしまうと言う事ですよね？

送信出来なくなったのは、POP アカウントでしょうか？　それとも IMAP アカウントでしょうか？

また、プロバイダ等は何でしょうか？

ここにあったcom.apple.dock.plistを移動メニューで~/Library/Preferencesで移動。

このコメントの意味が良く分からないのですが、「ここにあった com.apple.dock.plist」と言うのはルート直下の /Library/Preferences 内の「com.apple.dock.plist」の事ですよね？

それをホームフォルダ内の ~/Library/Preferences に移動させたと言う事でしょうか？

私が前のコメントで書いたのは、

● 誤って「ゴミ箱」に入れてしまったルート直下の /Library/Preferences 内の「com.apple.dock.plist」を「ゴミ箱」を開いて「com.apple.dock.plist」を選択し、右クリック ＞「戻す」で元の場所に戻す。

● ホームフォルダの ~/Library/Preferences 内の「com.apple.dock.plist」を「ゴミ箱」に入れて Mac を再起動後に「Dock」の設定を行ない、再び Mac を再起動して確認。

と言う事なのですが・・・。

まず、誤って削除、或いはホームフォルダ内の ~/Library/Preferences に移動させた、元々ルート直下の /Library/Preferences 内に有った「com.apple.dock.plist」（私の環境では、2014/10/17 に作成された僅か 108 バイトのファイル ）を元のルート直下の /Library/Preferences 内に戻して下さい。

それから、ホームフォルダの ~/Library/Preferences 内の「com.apple.dock.plist」に関する一連の操作を行って見て下さい。

お書きに内容から考えると設定ファイルは別にあるのではないでしょうか。もしかするとdb 形式かもです。

一旦「com.apple.dock.plist」を「Prefarences」から出してみましたが変化なかったので戻しました。

Preferences内にcom.apple.dock.plistは何故か再生成されていません。

念のための確認ですが、ホームフォルダ内の「com.apple.dock.plist」で間違いないでしょうか。

確認してみました。macOS Sierra ですが、お書きの設定ファイルを削除するとDock が初期状態に戻りました。

その「移動」だと、アクセス権が関係するので、挙動不明になる（ex. 書き換え不可）のでないかと思われる。

すなおに、ホームのライブラリからそのplistを削除してみればいいだけのような。