iCloud Driveから全てのファイルを撤収したい。

『iCloud Driveを利用するのCheckを外す』との事ですが、Macのシステム環境設定＞iCloud、で表示されるチェックの事でしょうか？　

その場合、そのチェックを外すと、データをMacに残すか（コピーを残す）、それともMacから削除するかを選択するダイアログが表示されます。　コピーを残すコマンドを選択すると、ホームディレクトリにiCloud Drive（アーカイブ）というフォルダが作成されます。　コピーを残す場合も、Macから削除した場合でも、iCloudサーバー上にはデータは残ったままです。　ウェッブブラウザを使ってiCloud.comのiCloud Drive Web Appを表示して、サーバー上のデータを確認してみてください。

iCloud Driveの控えが~/library 配下を辿って行くと有りますので、それを空いているドライブに移せば良いのでは…。