iCloud からデスクトップを削除する

失礼致します。

お使いのMacのシステム環境設定＞iCloud＞iCloud Drive＞オプション…、と進んで、『デスクトップフォルダと書類のフォルダ』のチェックを外します。

　→ デスクトップと書類を iCloud に保存する

デスクトップフォルダだけをiCloud Driveから外すことはできないと思います。

また、チェックを外した後で、ウェッブブラウザを使って、iCloud.comのサイトにアクセスして、iCloud Drive Web Appを表示してみてください。　デスクトップと書類のフォルダが残っていれば、削除します。　但し、複数のMacをお使いで、デスクトップと書類の同期を行なっている場合は、それぞれのMacに影響が出ないか注意してください。