ディスクユーティリティで再インストールしたときってBootCampのWindowsって消えてしまうのですか?

ディスクユーティリティで再インストールって、どうされたのでしょう？

ディスクユーティリティ単独では、ディスクの修復とかパーティションなどの管理とかができるだけで、再インストールとかできませんけど。

macOSユーティリティでmacOSの再インストール、という意味でしょうか？

macOSの再インストールとかアップデートとかではWindowsが消えることはありません。ただし、macOSを消去してから再インストールだと、Windowsが起動しなくなることはあるかもしれません。もちろん、ディスクユーティリティでディスクを消去してしまえば、Windowsも消えます。