ikkei152さん、こんにちは
えーっと、まず、正規サービスプロバイダではアップルの提供するパーツに交換し、非正規店で使用されたであろう非純正パーツに交換した場合には色々と面倒な事になると思います。また、非正規店で交換した際になくしたのであれば、その機械は改造品と見なされる可能性があります。多分、コールセンター経由かジーニアスバーでは交換してもらえると思いますが、無くしたねじの分は別請求になる可能性があります。
とりあえず、ここで聞かずに、アップルのコールセンターに問い合わせてください。
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いとうみきでした