macOS Serverで中間証明書を認識させる方法は？

Mac OSX10.11.6 Server(var.5.2)で、webサーバーを運用しています

OpenSSL 1.0.2oです。

さくらインターネットでドメイン認証型の証明書を取得してmacOS Serverに認識させ、SSL通信のwebサービスを実行しようとしましたが、ブラウザで「この証明書は不明な機関によって署名されています」となって失敗しています。Serverに中間証明書と証明書を両方認識させる手順が知りたいです。また、鍵ペアはServerに証明書を登録するときに自動的に生成されるのでしょうか？

さくらインターネットの説明では、ターミナルを利用して鍵ペアを生成して証明書とともにhttpd.confに設定するということでしたが、これも失敗しました。手順に沿ってCSRと鍵ペアをを生成したので、Serverの機能とバッティングしたのではないかと思っています。

新たな登録をしようとすると新しいCSRの発行から始めなければならないので、簡単にはテストできません。

同じような経験のある方がいましたら、教えてください。