ご返信ありがとうございます。HighSierraの方だったのですが、
サポートで解決策を教えて頂けました。念の為以下に内容挙げさせていただきます。
以前内蔵HDをSSDに換装した際に、まるごとシステム内容をコピーしたつもりだったのですが、
その手順だと隠しパーティションがコピーされていなかったようで、以下の回答をいただきました。
まずMacのシステムディスクの中には、Macintosh HD以外にも隠しパーテーションが複数存在しており、その中の情報をアップグレードの際に必要とすることがあるのですが、今回行われた作業内容ではこの隠しパーテーションは換装したSSDにはこぴーされていないために、該当のエラーが起きたという状況でございます
ちなみに、コピー手順は以下の内容でした。
(1) SSDをハードディスクケースに入れ、MacBook Proに接続します。(2) 「ユーティリティ」フォルダの「ディスクユーティリティ」を起動して、「消去」で、SSDを「Mac OS 拡張(ジャーナリング)」に消去します。(3) おなじくディスクユーティリティの、「復元」で、「ソース」を内蔵ハードディスク(デフォルトではMacintosh HD)、「復元先」をSSDに指定して、「復元」を行います。これを実行すると、起動可能な状態で、内蔵ハードディスクが、SSDにフルコピーされます。(4) SSDをハードディスクケースから取り出し、MacBook Proの内蔵ハードディスクと交換します。
解決策としては以下の手順でOSをインストールし直す事になりました。
1.Command+Shift+Option+Rでインターネット復元でこのMacを起動させる
2.ディスクユーティリティにて1パーテーションでこのSSDを消去する
3. 「macOSの再インストール」よりOS10.11の初期化インストールを実施(この時の作業で隠しパーテーションが作成される)
4.初期設定を行う この時データの移行はまだ行わない
5.初期設定完了直後でMac App Storeより10.13へのアップグレードを実施
6.アップグレード完了後に「移行アシスタント」にてバックアップしていたデータを戻す