失礼致します。
下記リンクの「ギフトカードやコンテンツクレジットがある場合」の項目に以下の様に記載されていますので、本来であればギフトカードの残高が購入する曲の価格以上であれば、全額ギフトカードの残高から差し引かれ、ギフトカードの残高が購入する曲の価格に満たない場合は、登録しているクレジットカードから差額分のみが支払われるはずです。
- 決済にギフトカードをご利用の場合は、お取引の時点で購入額が差し引かれます。
- ご購入の際は、購入する商品の金額がクレジットの残高以下であれば、コンテンツクレジットが一番先に使われます。
- ギフトカードが次に使われます。
- ギフトカードの残高が購入総額に満たない場合は、ご登録頂いているお支払い方法に差額を請求致します。
iTunes Store で購入したものの請求方法 - Apple サポート
ギフトカードの残高が有るのに、全額クレジットカードから支払われると言うのは、明らかにおかしいと思いますが、一般ユーザにはどうしようも有りませんので、Apple サポートに連絡して事情を説明し、対処して貰って下さい。
【 Apple サポート 】
● 電話番号 : 0120 - 27753 - 5 (受付時間 : 午前 9 時 〜 午後 9 時)