mojaveインストーラの検証中にエラー

> また同じエラーが出ました

そのUSBインストーラで外付けhddにクリーンインストールできるかどうかみてみると良いかも。もし、外付けにクリーンインストールならできるということであれば、上書きインストールしてるel capitanのシステムに何かmojaveのインストールを阻むものがある（mojaveに対応してないユーティリティやアプリ？）可能性が高いと思われます。外付けhddにクリーンインストールしようとしても同じエラーが出るなら、mojaveのインストラのダウンロードに問題がある可能性が高くなります。

> USBへのダウンロード中に同様のエラー

リンク先のやり方はダウンロードしたものを利用してUSBインストーラを作り、それでインストールするという方法ですが。そうされましたか？

USBインストーラを作成する方法：

macOS の起動可能なインストーラを作成する方法 - Apple サポート

注意：インストールUSBを作成する際に利用するUSBは、あらかじめディスクユーティリティでGUIDパーティション方式、macOS拡張でフォーマット（USB本体を消去、macOSのバージョンによりディスクユーティリティの表示で全てのデバイスを表示にしないとUSB本体が見えません）しておきます。このフォーマットにしておかないとできたUSBインストーラでマックを起動できません。

Mojaveのインストーラをダウンロード・アップグレードがうまくゆかないなら、インターネット復元を利用するのも手です。起動時option + command + rとすると真っ黒の画面に回転する地球儀が出てインターネット復元の画面になります。ここでmacOSの再インストールにするとMojaveにできるんじゃないかな？

Safe Boot 状態でやるとどうですか。

> インストールディスクを選択する画面で直にUSBを選択してダウンロードしていました。

えっ、インストールディスクを選択する画面てインストーラを実行したということですか？

USBインストーラを作成とはまったく無関係な操作です。

インストーラ.appをダウンロードできてるなら、あとはターミナルの上記文書に記されたコマンドを利用してUSBインストーラを作成するのですが。作成できたら、optionキーを押しなら起動してそのUSBインストーラを起動デバイスにします。

> あまりにも時間がかかりそうだったので途中中断

インターネット復元では、アップルのサーバと情報のやり取りをするようで、ネットワークの速度から想定されるよりは（ずいぶん）時間がかかります。

それだとどちらか判別できないのですが、Safe Boot 状態で試したのでしょうか。

確認ですが、Safe Boot 状態で試したのですよね。