ストレージのシステム容量が急に増えた

仕事でフル稼働しているため、初期化する勇気はありません。

　仕事で使用するならサブマシンは用意しておいたほうがいいと思う。

上書きインストールで改善しないのであれば、ユーザデータを確実にバックアップを取り、初期化後OSを新規インストールし、アプリケーションとユーザデータを戻すのがいいと思うの。

　仕事で使用しているマシンに関して、動いているのなら手をつけるなってのが原則。

OSのアップデートなどはメインマシンでいきなりやるのではなく、サブ環境で動作確認を十分してから導入するのがいいでしょう。

上書きインストールをされたのだと思いますが、更にSafe Boot もできないとなると緊急でバックアップを確保して、クリーンインストールするしかないです。

ただし場合よってはハードウェアのトラブルの可能性があります。

Safe Boot しないといういうのが、極めて深刻な破損を伺わせます。