アップルメンバーシップに加入したら、今までiPhoneに入っていた曲のほとんどが消えてしまって、PCのiTunesから同期しようとしても、同期できない。

普通はApple Musicに加入したからといってiPhoneの曲が消えてしまうようなことはないのですが…

NO9さんのコメントにあるように、iPhoneの「ミュージック」とiTunesの設定で「iCloudミュージックライブラリ」をオンにします。するとiTunesのデータがクラウドにアップロードされます（初回はある程度時間がかかります）。それをiPhoneでダウンロードするか、ストリーミングで再生するという流れになります（iTunesとの同期で曲を移すことはできません）。iPhoneのストレージに十分な余裕があるなら、「自動的にダウンロード」をオンにしておくと、iTunesでCDを取り込んだときに「iCloudにアップロード→iPhoneにダウンロード」という操作が自動で行われます。

これでiPhoneの曲が元に戻らないのなら、ほかに原因があると思います。

iPhoneやiTunesはいつからか音楽の管理方法が変わってしまって

昔はPCローカルに保存された楽曲を端末に送り込んでいたのですが

今はアップル様から配信されたもののみ聴けるiCloudミュージックライブラリがオンになるのが標準なので

その場合ローカル登録されていたファイル楽曲は必ず消えてしまいます。

同期が始まる前にオフにできないなどとても残念でしたね。

私もこの仕様変更は大変残念でした。

かなりこだわって作り上げたライブラリですがApple配信のファイルに上書きされてしまったりしました。

アップルメンバーシップに加入しました。

「アップルメンバーシップ」ではなくて、"Apple Music（アップルミュージック）メンバーシップ"ではないんですか？（多分、「アップルメンバーシップ」というのは無い。）

で、Apple Musicの場合は、

PC版のiTunesから同期しようと思って色々試しましたが、同期できず、困っています。

iCloudミュージックライブラリ経由になるのでは。