AFSで構築されたシステム使用時においてのlaunch padのアイコンの整理方法

初めまして、色々と調べていたのですが見つからないので質問させてください。

現在、AFSでMojaveをインストールして使っています。最近、アプリの整理をしており、Launch　Pad使用している時に表示されるアプリが複数のページにまたがっていたり、名前順ではない状態になっております。

色々と調べて、Launch padをリセットするコマンドを見つけて実行してみたのですが、何も変化がありません。

defaults write com.apple.dock ResetLaunchPad -bool true; killall Dock

調べてみるとファイルシステムがAFSの場合はうまく動作しないみたいです。

どなたか対処法をご存知の方がおりましたら、ご教示頂けますでしょうか。