PCからiPhoneに同期した写真をicloudへ保存する場合について

初心者で申し訳ありません。

上記についてご質問させてください。

使用しているのはwindowsPCと、iPhoneSE（旧）です。

現在、不定期に、iPhoneで撮影した写真をPCに取り込み、フォルダ等で整理し、

これをiTunesの同期機能を使ってiPhoneに再度取り込んでいます。

（バックアップ兼フォルダ整理のために行っています。面倒に見えるかもしれませんが…。）

この度、

新SE購入の検討にあたって、容量を検討しており、

iCloudの活用についてご質問させていただいた次第です。

まず１点目に、「PCからiPhone同期して取り込んだ写真をicloudに保存できるか」です。

現状、PCからの同期によりiphoneに取り込んでいる写真があります。

iCloud写真をオンにするとiphoneから写真を削除してicloudに移行できるとのことですが、

PCから取り込んだ写真も同様にiphone本体から削除され、iCloudに移行するのでしょうか。

自分で調べてみたところ、

「iPhone、iPad、iPod touch から写真やビデオを転送する（https://support.apple.com/ja-jp/HT201302）」に

「iTunes から iOS デバイスに写真を同期した後で、iOS デバイスで iCloud 写真を有効にした場合は、「iTunes から同期した写真とビデオは削除されます」というメッセージが表示されます。コンピュータから同期した写真とビデオはコンピュータ上には残りますが、iOS デバイスからは削除されます。」

とある一方で、

「iCloud 写真に問題がある場合（https://support.apple.com/ja-jp/HT204570）」の

「iCloud 写真を有効にした後で写真やビデオがなくなった場合はどうすればよいですか？」に

「iTunes を通じてデバイスにコピーした写真やビデオは、iCloud 写真にはコピーされません。」

と記載されており、混乱しております…。

これは上記のような対応はできないということでしょうか。

２点目に、上記のようなことができた場合、PCで同期元のフォルダから削除された写真は、

iphoneからも削除されるものと思いますが、同時にicloudからも削除されるのでしょうか。

仮に、データ整理のために写真を削除する場合に、

「icloudにいったんアップしてしまった写真はPCから削除してもicloudには残ってしまうから、

　icloudから削除するには別途作業（PCと同じ写真を探して削除していく作業等）が必要」

ということだと面倒だな、と思った次第です。

３点目に、１点目の方法が不可能だった場合、PCからiPhoneに同期するのをやめて、

iPhoneで取った写真をいったんPCに取り込み、PCからiCloudに同期し、

iPhoneで閲覧するという方法をとると問題（iCloudに２重で同期されてしまう等）が

ありますでしょうか。

その他、おすすめの同期方法があればご紹介いただけると助かります。

できればPCをマスターのように扱って、一括で整理したいと思っております。

長文乱文失礼しました。

よろしくお願いします。