この現象、私も2ヶ月前になりましたよ。
Mac mini 2009のHDDがお亡くなりになったので、SSDに交換して10.11 ElCapitanをインストールしようとしたら、全く同じ状態になりました。
何度インストールしても、必要なパッケージがないと表示されちゃうんですよね?
インストールの際に、Appleのサーバーから必要なファイルをダウンロードしながらインストールしているんですけれど、何故か途中で、Appleのサーバーにアクセス出来なくなってファイルが取得できないため、インストールプロセスがエラーで止まってしまうんです…。
ディスクユーティリティでHDDを修復しようと、HDDを初期化し直そうと、初期出荷時のOSに戻したり、外付HDDから起動してインストーラをダウンロードし直して内蔵HDDにインストールしようとしても、どれも同じ現象で止まります。
(既に、正常に10.11のインストールが出来ている外付HDDの復元ディスクからインストール出来る環境があるなら成功します)
よって、私が同じトラブルで検証した限り、貴方のMacBookのHDDの空き容量が少ないわけでも、インストール方法が間違っているわけでもありません。
色々と試行錯誤をした上で、私が解決した方法としては、上記のように、正常にインストールが完了している外付HDDの復元ディスクからインストールする。
ただ、普通の使い方をしている方は、そんな用意はないでしょうから、USBメモリを使って10.11 ElCapitanのインストールディスクを作成して、そこから起動してインストールし直すことです。
https://support.apple.com/ja-jp/HT201372
これ以外の方法では、本当に何を何度やっても、10.11のインストールが途中で止まります。
私も、この現象の原因を探る検証をするために、丸2日も潰されました…。