全てのアプリが起動に時間がかかりすぎる

私もこの前まで使っていた機種ですが（私の場合はFusion Driveでした）、HDDだとしても起動に10分、スリープからの復帰にも10分かかるのでは使い物にならないのでは？

ディスクの空き容量が少なすぎるということはないでしょうか。セーフブートやディスク修復で改善しないなら、OSをクリーンインストールし、初期状態で動作を確認してみてはいかがでしょうか。バックアップは日常的にとっておられますよね？

Late 2014はHDDでしたっけ？SSDにしないと辛いかも？

先ずは、セーフブートまたはディスク修復でしょうか。