1台のMac Miniに2台のMagic Trackpadを繋ぐことって可能ですか？

やったことないので分かりませんが、無理なんじゃないかな。

bluetooth接続の場合、同じプロファイルで接続できるのは1つのデバイスということになってたそうです（bluetooth 3までの話）。過去形なのは、今ではその制限はない（bluetooth4以降は、特に取り決めがない）けど、そうなってる場合が多いようです（デバイスの仕様でそうしてる）。wifiを利用するairplay2ではなくて、ios機器に同時に複数のスピーカをbluetooth接続できるようにしてるものもあるそうですが、最初1台iphoneに接続して、そのスピーカから残りのスピーカに接続できるようにしてるそうです。なので、この場合でも、直接接続してるのは1台だけです。

有線のマウスなら、複数のマウスを繋いで、それぞれ独立に使うのはやったことあります。この場合なら問題はありませんでした（それぞれのポインターが出てきて、独立に操作できる）。なので、bluetooth接続さえクリヤーできれば、使える可能性は無いことはないかもしれませんが、やってみないと分からないというのが正直なところです。