AppleIDと電話番号は紐づいていますか？

便宜上現在のIDを旧IDとします。

旧IDに登録している携帯番号を別の電話番号（例えば自宅）か登録自体を削除すれば、旧IDと携帯番号は紐付きが切れます。

そもそもですが、ID自体の削除（抹消）手続きを取るのが最も確実かも。

その状態で新IDの電話番号として携帯番号を登録すれば良いんじゃないですか？

ただし、携帯番号で登録してあるようなサービス（Lineなど）や知人の住所録など、お子さん個人と携帯番号の紐付きは継続されます。

ここはどの程度のリスクなのかはご本人でなければわからないので、なんともです。

全てを刷新するなら、これを機に電話番号も変えると良いです。

また、6sのSIMはそのまま流用できないかもしれないので、キャリアに確認してください。

旧IDに登録している電話番号を変更すれば紐付けは切れます。

旧IDは今後使わないなら、削除しちゃっても良いかも…

できるかどうかの確証はないですが…

>繋がりたくないお友達ともLINEが繋がっている為、これを機にブロックではなく新しく。。。）

なら、電話番号は変えないと。なぜ、MNPしますかね。

一時的に両端末のキャリア契約を維持し、利用しているサービスを個別に検討し、必要なものを移行する。

確認を終えた段階で、旧端末のキャリア契約を解消し、使っていたApple IDは支障ない内容に書き換えて放置（一定期間、アクセスが無いとAppleが無効化する）・。Apple IDを「削除」すると、思い出して何か（未完の手続きとか）をしたい場合にも何もできない。

Apple IDは以下の手順で変更すれば、アプリ、曲の利用権を引き継げますが、いっそのこと切っておく（完全に他人になる）方がよいかも。

Apple ID を変更する - Apple サポート