iTunesからiPhoneへの音楽同期の注意点

iTunesからiPhoneへ一部の音楽だけを同期したいと考えています。

Webでいろいろ調べたところ、

iPhone > 設定 > 概要 > オプション > 音楽とビデオを手動で管理

にチェックを入れて、移したい音楽だけをiTunesからドラッグ＆ドロップで移す、という説明を発見しました。

しかし、”音楽とビデオを手動で管理” にチェックを入れて適用を押そうとしたところ、

"iPhoneをこのiTunesライブラリと同期すると、デスクトップ上の別のiTunesライブラリからのメディアは置き換えられます。"　と出てきました。

怖くて作業を中止しましたが、これの意味を教えて頂けないでしょうか。

”同期して置換” を押してしまって良いものでしょうか。

よろしくお願いいたします。