１アプリの更新ごとに Apple ID パスワードの入力を求められます

ご自分のApple IDとそのパスワードを入れたら、全部アップデートできますか？

アップデートできないのがあれば、それは、何らかの原因で紛れ込んできたアプリ（他のApple IDで購入されたもの）です。

一層のこと、初期化して（設定＞一般＞リセット>すべてのコンテンツと設定を消去をタップ）最初から再構築してみては？

そうすれば、ご自分のApple IDを設定してダウンロードされるものばかりになり、他のApple IDで購入されたものは紛れ込んできません。

間違っていたらすみません。

設定＞名前＞メディアと購入＞パスワードの設定＞パスワードを要求がON

になってるからとか？

他のApple IDで購入したものが混在してるとかの可能性はどうですか？

他人のパソコン（あるいは他人のアカウント）に繋いだりするとそういうことが起こる可能性があります。

同じ手順ですが、いまだかってパスワード入力を求められたことは無いです。

>なぜかアプリの自動アップデートがされず、手動でやろうとおもったところ、

通信不良か長期の不使用で、App Storeアプリのサインアウトが発生したのでは。