ギフトカードが使えてるかどうかわからない

購入確定の段階でギフトカードを指定したかどうかなのでは。

今だと、ギフトカードのコードを購入時に入力するのではなく、アカウントに事前チャージしておく方（ハード、ソフトのどちらの購入にも使えるようになった）が無難だと思うけど。

>Apple Watchを購入した際にギフトカードを使用したのですが届いたメールにはその引いた分のお金じゃなくて普通にそのままの値段が書かれていたのです

普通、領収書には、販売価格（＝購入価格）が書いてあり、その内訳として支払い方法（ギフトカード、チャージ残高、クレジットカード払い）が明記されるのでは。そうなってないんですか。

ギフトカードは値引きじゃないと思うが。