iPhone 非純正 のバッテリー交換の後Apple で純正品バッテリーに交換してもらえるか

サポートに相談してみてください。

本来は、非正規修理店で直した場合はNGです。

以前 ネジが外されたことがわかって 修理を拒否されたという話がありましたが、

何年か前にバッテリー交換のサービスが年末に殺到した時は 正規修理店以外でもバッテリー交換OKということもありました。

お問い合わせ - Apple サポート (公式)

5年前にこんな報道もされていましたが、現在はどうなっているかは分かりません。

非正規で修理したiPhoneも純正修理対象に！Appleが方針変更

https://iphone-mania.jp/news-161925/

Appleに直接確認が確実かと…

お問い合わせ - Apple サポート (公式)