iPhone - PayPayでゲームアプリに課金したが、残高から引かれてない

Appleの購入履歴は保留になっております。

これって時間と共に解決するやつですか？

勝手には解消しないと思います。

保留を解消しないと買い物、課金できなくなるかも。

こちらあたりを確認してみてください。

App Store や iTunes Store で支払いが拒否された場合 - Apple サポート (日本)

「前回の購入で、お支払いに問題がありました」または「確認が必要です」というメッセージが表示される場合 - Apple サポート (日本)

もう解決してると思いますが

そのうち1週間程度でいつの日か引き落とされます。

もしPayPay残高不足で引き落としができてない場合は近いうちに無料アプリも支払いするまでダウンロードできなくなります。

なんか支払いしてくださいみたいな注意書きがでてきます。

その場合は残高補充したあとすぐに支払いされで支払いされるとすぐダウンロードできます。

それってりんごのカードって課金しましたか？

課金でも買えますが，コンビニエンスストアやトイザらス、イオンモールやAPiTA。今では，ドラッグストアのほぼ全店で購入することができます。1，000円〜100,000円の値段から，欲しい値段1円単位で購入することができます。