アップルID共用の2台のiPhoneの着信履歴が同期する問題

双方のデバイスでオフにしているにもかかわらず、とのことなら、あとは

「すべての設定のリセット」をして、改めてそれらの設定をオフにするしかないかもしれません。

まれに設定があべこべになっている場合、（設定していないのにされている、その逆も然り）

「すべての設定のリセット」で設定がまともになることがあります。

iCloud driveをオフにすると共有されなくなるそうです。

iPhoneの通話履歴が共有される - Apple コミュニティ

設定＞電話＞他のデバイスでの通話＞許可＞オン

になっていたら、オフにするとか。