外付けHDDのパーティションを2→1にしたい

消すとおっしゃってるのはボリュームです。

現在パーティションはどうなってるのでしょう？

例えば、もしAPFSになってるなら、パーティションには2通りのやり方があります。同じコンテナ内に2つのパーティションがある場合と、コンテナ自体が別になってる場合です。同じコンテナ内に2つのパーティションがある場合には一つのパーティションを消せば、全体が一つのパーティションになります。コンテナが別になってる場合には全体を初期化しない限りディスク全体のボリュームにはできません。

macOS拡張とかだと、パーティションはボリュームと物理的には同じものになります。でも、本来はパーティションとボリュームは違うものです。macがディスクを読み書きできるにはボリュームでないと読み書きできません。パーティションだけがあってボリュームがない状態だと、ファインダーから見た場合、ディスクは見えませんし、読み書きもできません。

中身が消えても良いなら、ディスクユーティリティの表示を全てのデバイスを表示にして、問題の外付けディスク本体を選択し、消去のボタンをクリック、出てきたウィンドウで、名前：適当、フォーマット：APFS、方式：GUIDパーティションマップとして消去のボタンをクリックとすれば良いです。

>もう一つを同じように消去すれば、パーテーションも自動的になくなるのでしょうか。

そんな訳は無い。

はにさんのアドバイス通りの方法で全体を初期化する。