Mac - 書類のファイルサイズが違う

iCloud Driveでデスクトップと書類フォルダの同期は設定されていますか？

それならば、iCloud上の書類の保存場所とお使いのMacのストレージ上の書類の保存場所とは、一致しないので、ずれがでてくるのは当然です。　iCloud上の書類は、Macと同期されますが、オリジナルは、iCloudサーバー上にあります。　一方で、Macの一般＞ストレージの書類は、iCloud上のものではなく、そのMac上にだけ存在するものも含まれます。　なので、サイズが違うのは、当然です。