PC上の動画をiCloudにアップロードしたい

iCloudにアップロードできる写真や動画には形式の制限があります。

サポートされているファイルの種類

* iCloud 写真には、写真ファイルとビデオファイルのみを転送できます。その他の種類のファイル (モーションフォトや Live Photos、メモリーなど) は転送できません。

* JPEG、HEIC、PNG、GIF、TIFF、BMP 形式の写真ファイルと、大半の MP4 形式と MOV 形式のビデオファイルは転送可能です。

* iCloud 写真に転送できない写真やビデオファイル (RAW ファイルなど) は、iCloud Drive に転送されます。

動画の形式を確認してください。

その動画はこちらで閲覧できますか？

→https://www.icloud.com/photos/

それであれば、iCloud写真にその動画はアップロードされていません。　そのため、同期しているiPhoneでもみることはできないです。

なので、iCloud for Windowsの設定を見直すか、一旦アプリをアンインストールして、再度、アプリをインストールし直すとどうでしょうか？