iTunesからMusicに取り込んだ曲が、iPhoneを充電器にセットしたタイミングで消えてしまう

追記：たぶん「オートフィル」が原因だと思うので…

オートフィルを使い続けたいのなら、

・Wi-Fi同期をオフにする

・充電はコンセントにアダプタを挿して行う

・曲を入れ替えたいときだけパソコンに接続する

オートフィルを使っている理由が、すべての曲をiPhoneに入れられないからというだけなら、

・iTunesで好みの曲を入れたプレイリスト（複数でも可）を作り、そのプレイリストを同期する

が解決策になるのでは？

オートフィルでは、入れる曲を自分で選ぶことはできなかったように思います（その後変わっているかもしれませんが）。

後者の方法なら、パソコンに接続しても曲が勝手に消えることはありません（そのときプレイリストに入っている曲が同期されるので、プレイリストから消した曲は消えますが）。プレイリストの内容は適宜変更できます。

iPhoneから消えたで合ってますか？

iTunesって事はWindowsですか？

iTunesのバージョンとWinのOSはなにですか？

iPhoneから消えたなら、iTunesの同期設定がおかしくなっていないか確認してみてください。

同期なので、設定が狂うと（同期の対象から外れる）と次回の同期時にiPhoneから削除される事はあり得ます。

こちらなども参照してみてください。

PCのiTunesコンテンツをデバイスと同期する - Apple サポート (日本)

”手動で管理”はオンになっていますか？

WiFi接続でこの設定がオフだとオートフィルは効かず、iPhoneを電源に接続するたびに自動同期が行われます。

そのとき自動同期でどれを同期するかが設定されていないと、その度にiPhoneの曲が消えることにならないかな？

「Wi-Fi同期」がオンになっていませんか？

PCのiTunesコンテンツをWi-Fi上のデバイスと同期する - Apple サポート (日本)

平たく言うと，

iPhoneに転送した曲を，もう転送したからとPCから削除してませんか。

「同期」する設定になっていると，iPhoneから当然のごとく消えていくと思います。

iTunesには曲は残っているのですよね。

＞musicを開いた状態で充電器を挿したところ

コンセントに挿して充電していますか？

パソコンに挿したということなら、iPhoneの同期設定を確認した方がいいかもしれませんね。

オートフィル？

そういう設定は今でもあるんですか？

iPod shuffleの時代に、容量の少ないshuffleに音楽を入れるのに、その設定がありましたが…

「オートフィル」は同期するたびに音楽を入れ替えるので、これまでの音楽が消えるのは想定の範囲ではないかと…（違うかな？）

Windows機をもってないので僭越ですが，「オートフィル」とやらが怪しそうな気がします…。

D300さんとPajerowが載せてくださっているリンクをよく読んでみてください。

すいません，Junkotさんと被りました。