この環境でのウィルス対策

ウイルスは目的とした環境／OSでしかうごきません。
それにべつなパーティションです。BootCampドライバによりHFS+が読めるかもしれませんけど基本的にはべつなのでウイルスは自分自身をコピーしようとはしないとおもいます。
基本的にWinがウイルスに感染すればそのWinのみがダメージを受ける。Winパーティションを消せばウイルスも消えます。

MS Officeのマクロウィルスのように、OSに依存しないものもありますので、絶対に影響を与えないとは断言しきれません。
いずれのOSでも万全の対策をしておくことが原則です。
しかし、最新ウィルスがやってきたときは万全の対策も役に立たないことがあります。
日々のバックアップ(TimeMachineのように過去の任意の時点に戻れるもの)こそが、基本中の基本です。