外付けHDD起動の速度は？

まず、使える外付けドライブは、起動ディスクにする必要があるので、FW400 のみです。内蔵SATA に比べれば、体感でも遅くなったと分かる程度には遅くなります（自分は、iMacG5 ではなくて、PMG5 2.5dual での話です）。しかし、我慢できないほど遅くはありません。
しかし、Phtoshop EL を使うとファンが回り出す対策としてはどうかな、というのが正直なところです。たぶん、あまりHDDは関係ないのではないでしょうか？そうだとすると、FW400 から起動したところでやはりファンは回りだし、熱対策の助けにはならないうえ、遅くなる分だけ損した気分になる気がします。この場合の熱はやはり cpu からの寄与が大きいのでは？、と思います
ま、一般的に、クラッシュ対策として、FW接続のHDDを用意しておくことには賛成しますが。

NOVAC.HDDもっとはい〜るKIT 1394(ケース)ですが
特に速度は変わらないと思います。熱は多少?かな・・・
USBは起動不可ですね。IntelMacでWinは知らないですが。。。
被りました(_ _

起動には使っていませんが、iMac G5にBuffaloの250GB FireWire HDDをつないでいます(システム入れ換え時に起動に使ったことはありますが、速度計測してません)。
数字上はFW400だと内蔵SATAの半分程度の速度しか出ないことになってますが、データ用として使っている分には気になるほどではありません。
起動ディスクにしてみたところで、速度差が効くのはシステムやアプリの起動時間程度のものですから、動画編集とかするのでなければ大きな問題はないと思います。
速度を気にするのであれば、構成は今のままで外付けHDDにバックアップをこまめに取るという方がよいでしょう。内蔵が壊れても外付けが壊れても対応可能なので。
#USBは勧めません。USBのデータ転送は数値ほどの性能が出ません。また、USBだとiMac G5では起動ディスクになりません(Intel CPUのはUSB起動できるそうです)。なお、FWでも全てのモデルが起動可能ではありません。MacOS X起動可能モデルであること確認して買ってください。
#自分のもリペアプログラム対象ですが、確かにファン回転開始は早いですよね。CPU温度を見ているとあっという間に80度に達するのでちょっとはらはらです。対策はがんがんに冷房を効かせるしかないと思いますが、自分の部屋にはエアコンすら無いので重い作業を連続して行う時は扇風機で送風してます。

皆様、アドバイスありがとうございます。
外付けHDD起動も遅いながらも実用には耐えられそうですね。
最悪バックアップ用にでもFW400タイプの物を購入しようと思います。
そこでご質問なのですが、多少値が張っても構わないのでおすすめのドライブなどございますでしょうか？
よろしくお願いいたします。

より良い機種があるかどうか知りませんので
お勧めという訳ではありませんが
当方のiMacG5(ALS)で起動も可能ということで
BUFFALO HD-HB160IU2 を使用しております
一応システムも入れていますが
通常の使用形態はファイル用（バックアップ含）です
尚、同シリーズでは160GBから400GBまであります（2006年４月現在）

自分がiMac G5につないでいるのは、BuffaloのHD-HB250IU2です。
PowerBook G4にはLaCieのd2 Hard Drive Extreme with Triple Interface 160GBと300GBをつないでます。
BuffaloのはFW400/USB2.0, LaCieのはFW400/FW800/USB2.0のインターフェイスです。
いずれのドライブもFW接続なら起動ディスクとして機能します。
また、これらのいずれもケースで放熱させるタイプでうるさいファンはついていません。Buffaloのほうは電源部も内蔵されていて、ACアダプタは不要です。
お勧めというか、自分の趣味はLaCieのほうです。堅牢そうな造りとデザインが気に入っています(FW800が付いている分だけ高いですけど)。LaCieはデザインの継続性もあるので、後から買い足してもすっきり並びます。日本メーカーはとかくデザインをころころ変えるので、旧モデルと新モデルを並べた時に見た目が美しくありません。