Previewを使ってPDFファイルを部分的に選択してコピーしたものを，KeynoteやPagesにペーストすると，そのPDFのページ全体が表示されてしまいます．（オブジェクトの大きさは，選択した範囲なのですが…）
なぜか，部分的に選択したPDFをPreviewを使ってPDFファイルとして書きだしてから，Adobe Readerで開いてsnapshotツールでコピーしてペーストすると，うまくPDFファイルとしてその部分だけペーストすることが出来る時があります．（クリップボードにはビットマップと合わせてクリッピングされたPDFとして保存されているため．通常はPDFが優先されるようです）が，これも，運が悪いとページ全体が表示されるPDFとしてペーストされます．
今度のバージョンアップで直るかと思ったら，何も変わらずだいぶがっかりしています．
OSはTigerを使っていますが、Previewでの部分選択→コピー→Keynoteへのペーストで問題はありません。
Keynoteは4.0.2でもアップデート前の4.0.1でも正常動作しました。
どちらかというとLeopardのPreviewに問題があるのかも。
Tigerを使ってる時は自分も正常に動作してました．この症状が出るのはLeopardにしてからです．
あと，Adobe Readerからコピーするときちんとコピーできる時があるので，Previewが問題である可能性は高いのですが，Preview内部で扱う限りは問題ないですし，Adobe Readerからコピーしても時々失敗したりするので，LeopardのPDFの扱いが全体的に何かおかしいのかもしれません．
PDFが画像のみの場合は選択した箇所だけをコピペできますが、テキストが入っているとその選択した箇所を含むページ全体がコピペされるようですね。
プレビューで開いたら，ファイル→グラブで選択範囲を開いて、Keynoteにコピペするとうまくいきます。ひと手間増えてしまいますが…
PDF ビューアに Skim( http://skim-app.sourceforge.net/ )
ver 1.1.3 を使用するとうまくいきました。
＃それ以前のバージョンではうまくいきませんでした。
また、PDF ビューアに Texshop( http://sourceforge.net/projects/texshop )
を使用するとうまくいくという情報もありましたが、（私の環境では）PDF としてはペーストされましたが、なぜかペーストした部分の背景が透明化されませんでした。
というわけで私は Skim の方を快適に使用させていただいております。もしかすると環境によって動作が異なるのかもしれませんので、両方お試しください。
私も全く同様の不具合でうまくいかずに困っていました。
Acrobat で開いてスナップショットでしのいでいましたが、
図の引き延ばし等をする絵が荒くなって使いづらいです。
グラブで選択範囲を指定する方法もスナップショットと基本的に同じようで、
加工にはあまり向いていない感じがしました。
プレビューで開いて選択した後、Word等に貼付けるとうまくいくことから、
KeynoteとLeopardの問題のようですね。
Keynote08とその以前のKeynoteの両方で同じ不具合がでました。
クリッピングされたPDFのペーストが不安定です
