>ご指摘の通り壁を越えられない・・・。
昔からプログラムなどをいじっている人には抵抗感は少ないと思いますが、普通の人には確かに難しいですよね。編集中には仕上がりが直接見えないので不安なんだと思います。しかし、逆に文章の中身に集中できるのがTeXの良いところだと思っています。ワープロでも文だけ入力して、後から整形するというスタイルを貫けば良いのですが、見えているとついいじりたくなってしまうので ^_^;;;
>1. LaTeX/BibTeXでの文献管理というのは、文末に文献リストを自動生成させるようなイメージであってますか?
はい。
BibTeX用のデータベース(bibファイル)を作成しておいて、各文献に参照キーをつけておき、例えば参考文献を引用したいところで、
「...という報告がある¥cite{bunken-1, bunken-2}。」
等と書いておくと、参照の出現順に 「...という報告がある[1,2]」というように番号付けを行い、文末に参考文献リストを作成します。
このとき、引用記号や参考文献リストの表示方法はスタイルファイルで定義されるため、スタイル定義だけ変えれば雑誌毎に異なる表示形式に対応します。
>2. 最近論文を書く際に引用する文献は自分でpdfファイルを既に持っているか、pdfファイル(全文)を無料でダウンロードできる論文に限るようにしているんですが、そういう場合に上述のendnoteやbookendではpdfファイルとデータベース内の個々のデータをリンクして保持する事ができるんですが、これらのデータベースを活用する事ができるんでしょうか。
うろ覚えですが、endnoteとかはデータベースをbib形式で書き出せたのではなかったでしょうか?
もしendnote等のpdfリンク情報がbibファイルに書き出した時にも保持されているなら、同様なことは原理的には可能だと思います。
私はendnote等は使わずにBibTeXデータベースを直接編集するフリーウェアでpdfファイル管理も行っています。