受信したはずのメールが消えてしまうのはなぜ？

> サーバーには１週間保存されますので、outlookで受信し直しています。
サーバに残っているだけラッキー！？でしょうか。（笑）
とりあえず問題のアカウントの受信ボックス内のメールを、適当なメールボックスに退避させてから、メールボックスの再構築を実行してみてはどうでしょうか。
（問題のアカウントの受信ボックスを選択してから、「メールボックス」メニューの「メールボックスを再構築」コマンドを実行）
それでもダメでしたら、Mail.appが終了している状態で「ホーム/ライブラリ/Mail/POP-****」フォルダ内の「MessageUidsAlreadyDownloaded」というファイルを捨ててみてください。（****には問題のアカウントの名前が入ります）
それでもダメでしたら、Mail.appが終了している状態で今度は「INBOX.mbox」というファイルを捨ててみてください。
それでもダメでしたら、最後はアカウントを作り直してみてください。
このとき先にメールを退避させた受信ボックスの他に、問題のアカウントの下書き・送信済み・迷惑メール・ゴミ箱内のメールも消えてしまいますので、必要なメールは別のメールボックスに退避しておいてください。

fumiakiさん、わかりやすい返信ありがとうございます。
さっそく試してみます。結果は後日になると思いますが、ご報告させていただきます。これからもよろしくお願いいたします。

遅くなりましたが、経過報告です。不要なファイルを削除し、アカウントを作り直してみました。今のところ正常に機能しているようです。ご指導ありがとうございました。