10.3.5アップデート後IEやMailがフリーズする

クリーンインストールしてもすぐおかしくなってしまうというのが不思議です。10.3 でインストールされる以外のソフトがインストールされているのでしょうか？もしそうなら、10.3 だけにしてみたらどうでしょうか？
> 一日かけてクリーンインストール..
10.3 をインストールするだけならそんなにかからないと思うのですが。
10.3 をインストールしただけの状態でもすぐおかしくなるのなら、増設メモリーを外してみてはどうでしょうか？あるいはソケットに差し直してみるのもいいかも知れません。おっしゃるような広範囲の障害はメモリーや cpu のトラブルだとすると納得できます。メモリーのトラブルはApple Hardware Testでは問題なし、と出ることが多いようです。（通常の状態では正常でも、マシンに負荷がかかって、高温になると、メモリーが正常に機能しなくなる、ということもありえます）。メモリーは３ー５年の保証が付いている場合も多いので、メモリーがおかしくなっているのなら、保証の範囲内で交換してもらえる可能性はあります。
増設メモリーを外しても改善されないのなら、修理に出す方がいいと思います。

はに様、早速のアドバイスありがとうございます。ご指摘のとおり言葉の使い方が適切でなかったように思います。クリーンインストール後、一通り使える環境を再構築するまでほぼ１日かかりました。クリーンインストールすれば問題解決するものと思い込んで、急ぎすぎてしまいました。もう一度クリーンインストールとネット接続のみで異常が出るか確認しようと思います。

Virexをお使いのようですが、v7.5ではありませんか？
現在、技術的な問題があるということで、アンインストールスクリプトが公開されています。
http://www.apple.com/jp/support/dotmac/virex/

　kuro様、追加情報ありがとうございました。Virex v7.5の問題は全く知りませんでした。使っていたのはv7.2だったと思うのですが、Virexを消去してしまった後も問題が発生しているため、私のケースでは原因ではなさそうです。
　今回、クリーンインストールとネット設定のみで他にソフトを入れず試してみました。Safariは動きました。IEも動きました。外付けHDDに保存していたmpgファイルの一部が白紙アイコンになって開きませんでした。CD-Rへのデータ書き込みは２回に１回エラーが出て失敗しました。何か変です。ソフトウエアウップデートでアップデートをするといきなりSafariがフリーズしました。やはりFinderがまともに反応しなくなり、強制終了もできなくなりました。アクセス権の修復を試みるとプログレスバーが４分の３ぐらいまで進んだところでフリーズしました。裏蓋をあけて増設メモリを外してみようと思いましたが、メモリを押さえてるプラスチックのバーが折れそうで怖いので触らずに閉じてしまいました。メモリ、本体とも保証期間が残っていたので、修理に出そうと思います。

すみません、追加訂正します。mpgファイルが白紙アイコンになったのは、MPEG-2 Playbackが入っていなかったため、開かなかっただけのようです。