それなら、ターミナルで pdisk コマンドを利用して、一度パーティションマップを初期化(initialize)してから、ディスクユーティリティでフォーマットしてみてください。
pdisk の使い方は、ターミナルで、
sudo pdisk /dev/diskX
とします(10.3 では違うかもしれません)。X は外付けだと、2 になると思います。あらかじめ、ディスクユーティリティで外付けドライブを選択しておいて、情報をクリックすると確かめることが出来ます。
管理者パスワードを入力すると、
Command (? for help):
と pdisk のプロンプトが出てきます。ここで、p とすれば、現在のパーティションマップを表示します。i とすれば、初期化します。初期化すると、p としても何も表示されなくなりますので、確認できます。
最後に、w として、初期化したパーティションマップを書き込みます。w をしないと、ディスク上のパーティションマップは変更されません。
最後に、q とすると、終了します。
この後、ディスクユーティリティを立ち上げると、 250 GB 全体使えるようになりませんか?
これでもダメなときは、前使っていたBigDrive に対応してない HDD ケースにセットし直して、この pdisk コマンドでの初期化をしてから、新しいドライブケースに入れて、ディスクユーティリティを試してみてください。