サイドバーにMacintosh HDが２個できる

外付けハードディスクをアンマウントした直後、サイドバーのデバイスにMacintosh HDがもう一つ現れて合計２個になることがあります。
外付けハードディスクはI-O DATAのHDC-U250です。内蔵ハードディスクはパーティションを二つにしていますが、追加されるのは必ず”Macintosh HD”の方です。問題なくアンマウントできることもあり、どういうときにこの現象が起きているのかはっきりしません。
アクセス権の修復、ディスクの修復は時々行っています。
現在、ディスクユーティリティでMacintosh HDを選択すると、”マウントポイント:/”と表示され、そこにカーソルを乗せると”file://localhost/”と表示されます。もう一つのパーティションは”マウントポイント:/Volumes/名前”であり、カーソルを乗せると”file://localhost/Volumes/名前”となっています。これはこういうものなのでしょうか？
10.4.10のときにはこういうことはなく、10.5にした後からこの外付けHDのアンマウントで問題が起きています。
アップグレードは内蔵HDに10.5を消去してインストールし、この外付けHDにバックアップした10.4.10を移行アシスタントで移しました。
その後からこの外付けHDの３つのパーティションのうち10.4.10のパーティションだけアンマウントできなくなりました（確かアプリケーションが使用中で取り出せないというメッセージだったと思います）。
その他、10.4.10で作成していたスマートフォルダの挙動がおかしく（内蔵HDを検索対象にしているのに、外付けHDの検索結果が表示されたり、ボリュームが見つからないというアラートが出たり、全く検索にかからない、あるいはすべてのファイルが表示されるなど）なりました。
Appleのサポートに問い合わせをしたのですが、よくわからないので10.5を再インストールし、外付けHDも一度消去した方がよいといわれ、内蔵HDに再度消去してインストールし、移行アシスタントを使用せずにホームのデータを移しました（このときはあらかじめスマートフォルダを削除しておきました）。そして、外付けHDもすべて消去した後、現在は２つのパーティションに分け、10.5のバックアップを保存しています。
また、同じI-O DATAのHDC-U400Gではこのような現象は起きていません（こちらには起動可能なシステムは入っていません）。
使用上問題は起きていないのですが、すっきりしないので理由と対処法をアドバイスいただけるとありがたいです。