質問です：一部のパーティションのみを初期化し直したい

ドライブを選択して特別メニューで初期化して下さい。

もしかしたら上の説明だけでは分からないかもしれないと思い、いちおう補足します。
　まず当然、初期化したいパーティション以外のドライブから起動します。この時、無論ＣＤから起動しても構わないですが、起動しディスクは絶対に初期化されないので、普段起動させているディスクから起動しておけば安心感があります（気分の問題です）。
　起動後、デスクトップに並ぶHDDアイコンのうち、初期化したいものを選択します。（クリックして暗転させる。分かるよね？）
　選択したら、特別メニューにディスクの初期化メニューがあるので、それを選んで初期化します。
以上です。
クドかったらごめんなさい。

ご返答ありがとうございます。
最初の僕の書き方が不十分だったのですが、
（１）MacOS拡張/OS9.1（２）MacOS拡張/OSX（３）使用しない
というパーティションの分け方をしてしまいました。
後でlinuxを入れようかと思っていたので、
（３）をとりあえず使用しないことにしてしまいました。
そのため、（３）はデスクトップ上にマウントされません。
この（３）を初期化するにはどうすればよいのでしょうか？
宜しくお願い致します。

＞（１）MacOS拡張/OS9.1（２）MacOS拡張/OSX（３）使用しない
ってことは最初のパーティション切りの時に未使用領域を作った
というか、ボリューム２つにしちゃったってことですよね？
だったらドライブ設定で再度パー切りやり直しだと思うのですが。
起動ボリュームのFINDER上からボリュームが選択出来ないんです
から仕方ないですね。
当然HDすべて初期化されます。

3番のパーテイションは分割したときに、”起動時にマウントしない“となっているんじゃないですか。ドライブ設定のウィンドウでボリュームを選択して、ファンクションメニューからボリュームのマウントを選べないですか？

可能です。
ただ、今後、linuxはインストールするつもりなのでしょうか。
しないのであれば、市販のユーティリティーソフトで可能なソフトがあった様な気がするのですが（うる覚えなのですみません）、インストールするつもりであれば、Holonlinux 2.0、、付属のPdisk(j)というソフトでMacOS上からパーテーションの変更が可能です。
ただしPowerBookG4にlinuxをインストールするのは、かなり骨が折れる作業でした。（私の場合）
拙いレスで申し訳ありませんが、参考になれば幸いです。

B'sCrewを使えば現在のパーティションを初期化しないで、
未使用領域に新規パーティションを作成することが可能です。

ご丁寧にありがとうございました。
ドライブ設定で再度試したのですが、
うまく出来ませんでした。
市販のユーティリティで挑戦してみようと思います。