goodreader　というアプリでホームページをダウン―ドする点について

GoodReaderというアプリケーションは、ファイルを見るためのアプリケーションです。なので、おやりになろうとしていることは目的が違います。

iPhoneやiPadのSafariでは、URLの先頭に「g」をつけることでウェブページをファイルとしてGoodReader上にダウンロード保存することは可能ですが、リンクのかかっている動画や画像、リンクCSS、CGIプログラムの類いは外され、純粋にHTMLソース（テキスト）のみがダウンロードされると思います（※.phpの場合はいろいろな形で開くことができるので、ビューアの選択画面が現れるのでしょう）。

どうしてもウェブページ全体をダウンロードしてGoodReaderで見たいのであれば、パソコン上でAdobe Acrobatの拡張機能「Web Capture」を使ってPDFに落とし込んでから、GoodReaderに転送することになります。

safariで保存したWebアーカイブは、Dropboxを経由するかWifi-transferでgoodreaderで読み込ませればWebページを読み込むことが可能です。

他のブラウザーのものも大丈夫だと思いますが、確認していません。

(FirefoxのWeb完全では、フォルダとHTMLの２本立てになるので簡単ではありませんね）

dropboxはあくまでもPCからiPhoneへのファイルの橋渡しをしています。

Goodreaderとは相性が良いので利用しているかたが多いソフトです。

iPhoneのブラウザーはsafariですんので、PCのSafariで作ったWebアーカイブとは相性が良いようです。

mhtファイルはそのままではsafariで開けないようですね。コンバートの方法はちょっと調べきれませんでした。

ちなみにiPhoneでリンクを押すと表示されるのはネットがつながっている状態でですよね？

そのまま新しいページ（保存されていない）へ飛んでいるだけかと。

Wifiきっているとリンクへ飛びませんよね？

PCでみているページと同じような画像付きの状態で保存したいのですが、

PC で見ている状態で，そのブラウザで「プリント」としてPDFで（ファイルとして）出力すればいいのでは？

アクロバットがインストールされているのなら、pdf で出力するための仮想的なプリンタが出来ていて，そのプリンタを選べば出来ると思いますけど。アクロバットリーダではその機能はありません。出力したpdfファイルを iPhone に移しておけばよいと思います。

MacOSX なら特に何もインストールしてなくても，素の状態で safari からプリントとすれば，（ファイルとして）pdf に出力できます。（Windows だとsafari だけで出来るかどうかは知りません。結構システムの広範囲の他のソフトも関係しますので）

MacOSX なら特に何もインストールしてなくても，素の状態で safari からプリントとすれば，（ファイルとして）pdf に出力できます。

Safariのプリントから、iTunesのiBooksへ直接PDFを送り込む方法もあります。

参考：Webドキュメントなどを簡単にiBooksに送る方法 | Macin' Blog

# ただし、iTunesで「ライブラリへの追加時にファイルを"iTunes Media"フォルダにコピーする」にチェックを入れていないと、PDFファイルはテンポラリフォルダに保存されたままになり再起動するとファイルが消えてしまうので注意。

最後につなげます。

質問された方の用途が不明なので、ずれている可能性がありますが、WiFi などが届かない場所での iPad を使ったプレゼン用途で、何かないか、と最近探したことがあります。そしたら、iSaveWeb / WebCopier Pro という製品がありました。iSaveWeb という安価な app を iPhone側にインストールし、一方 WebCopier Pro という有料の Mac/Windows 用パッケージを導入して、これでサイトをまるごとダウンロード・保存した上で、モバイルデバイス側の iSaveWeb に送る、というプロセスになります。

http://www.maximumsoft.com/

結局、こちらの事情ではサイトのデータはダウンロードしなくてもまるごとローカルにあるわけだし、何だか****しいという結論に達して、購入しませんでした/使用していません。ただ、用途に合えば使える可能性はあると思います。

また、iSaveWeb 単体で、1ページずつですが、画像を含めた web ページをキャプチャ・保存する機能がありますので、サイト全体ということでなければこちらで足りる可能性もありますね。

safariのWebアーカイブを転送してみる方法や、PDF化して見る方法などいろいろ提案がありましたので

是非一度試されてください。その上で不都合な点があったら質問されるといい方向に向かうと思います。

OSがマックではなくウインドウズXPでしてリンクをみたのですが、

ご使用のOS等の情報がないと的確なアドバイスは受けられないので、今後忘れずに記載されることをお勧めします。

どのようにしたらウインドウズでできるのでしょうか？

WindowsでPDF保存を実現するアプリケーションは数多く存在するのでいろいろ検索されてみるといいと思います。